极客范手游网小编主角战斗时，我们能看到星空深处一架又一架地球飞船陨落，里面全是反叛军的战士，我们甚至能看到他们在太空漂浮的诗海。付出巨大的牺牲后，反叛军和主角终于冲进了火星母舰，救出了被关押的摩登将军，但被火星人抓走的主角。
却不知所踪，已经就回老大的反叛军没有提前撤离，空中合金弹头他们跟随主角团继续战斗，终于他们找到了被抓走的主角，此时他被关在实验仪器里，然后被火星人克隆出一个又一个复制人，但主角之前感染过丧尸病毒，虽然服用过解药。
身体里却还有病毒残余，导致这些复制人全都是残次品。游隼小队救出了同伴，然后驾驶着空中合金弹头冲出了火星母舰，没想到巨大的火星之更突然出现，他把合金弹头坦克抓在手里，但别忘了游戏的名字就叫合金弹头。这辆萌萌哒小坦克也是有主角光环的，火星之根被打败了，他们一起掉进了大海，好在空中合金弹头上有救生气垫，有损小队成功活了下来。
摩登也带着他的手下们嚣张的从主角面前飘过，但双方再也没有战斗的心思，流水小队把手枪扔进了海里，象征着战争的结束，也再次把开发者的反战思想传达给了玩家。空中合金弹头的故事落幕啦，之后SMK倒闭。经过多次重组，合金弹头的剧情也变了味道。
